Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms