Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms