Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clcf1Q9QZM3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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