Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmlQ9QZD5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmlQ9QZD5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms