Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn8Q9QZ49 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms