Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf11Q9QYK7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf11Q9QYK7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms