Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms