Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms