Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms