Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms