Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms