Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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