Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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