Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms