Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms