Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn15Q9JLG8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms