Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms