Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms