Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms