Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms