Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3glb1Q9JK48 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms