Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms