Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx20Q9JJY4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms