Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms