Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms