Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a4Q9JIS8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms