Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnmb4Q9JIN6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms