Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms