Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms