Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms