Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms