Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim2Q9ESN6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms