Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim39Q9ESN2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim39Q9ESN2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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