Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms