Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk3Q9ERH7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms