Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr61Q9ERF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr61Q9ERF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr61Q9ERF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr61Q9ERF3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms