Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms