Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms