Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms