Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cxcr6Q9EQ16 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms