Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms