Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms