Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms