Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tspan4Q9DCK3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tspan4Q9DCK3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tspan4Q9DCK3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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