Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmg20aQ9DC33 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms