Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Csnk1dQ9DC28 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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