Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms