Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms