Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms