Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms